分居超过三年，想要申请离婚有两种方式：协议离婚和诉讼离婚。

　　1.协议离婚需要满足以下条件：双方都同意离婚，具有合法的婚姻关系，并就财产分割等问题达成了一致意见，同时双方都必须具有完全民事行为能力。

　　2.如果协议离婚的条件不满足，或者双方无法达成一致，那么就可以选择诉讼离婚。

　　（1）诉讼离婚的条件相对简单，主要是双方具有合法的婚姻关系，提起离婚诉讼的一方为婚姻关系当事人，且具有完全民事行为能力。

　　（2）在诉讼离婚中，需要向法院提交分居超过三年的证据，以及证明夫妻感情确已破裂的其他证据。法院会根据这些证据和法律规定，进行调解和判决。